먼저 findFragmentById나 findFragmentByTag를 사용해 제거하려고 하는 fragment를 찾은 다음
getFragmentManager().findFragmentById(R.id.fragment_id);
getFragmentManager().findFragmentByTag("tag");
remove 메소드를 사용해서 제거하면 될 것 같네요.
etActivity().getFragmentManager().beginTransaction().remove(fragment).commit();