NDK 빌드시 strip은 하셨을테구..
LOCAL_CFLAGS에 -fvisibility=hidden 를 추가 해보세요.
단 이 옵션을 쓰면, 모든 심볼이 노출 안되어 jni 로드 자체가 안 될 수 있으니
JNI로드시 호출되는 JNI_OnLoad의 경우
__attribute__ ((visibility ("default")))
jint JNI_OnLoad(JavaVM* vm, void* reserved)
와 같이 외부에서 심볼을 찾아야 하는 메소드의 경우
visibility를 default로 사용하겠다고 선언 해 주셔야 합니다.