해결된 줄 알았는데 아닌가보네요. 다시 답변 달아봅니다.
loadUrl("javascript:window.HTMLOUT.pageLoadFinished(document.getElementsByTagName('div')[0].scrollWidth, " +
"document.getElementsByTagName('div')[0].scrollHeight);");
위의 소스는 android에 구현한 javascriptinterface를 통해 javascript를 호출하는거구요.
asset폴더에 저장된 스크립트를 호출하고 싶으면
assetmanager를 통해 내용을 읽어온 뒤
javascript:+[실행할 스크립트] 이렇게 넣으시면 됩니다.